가족의 오랜 친구이자 천체물리학자인 딜버트 도플러 박사의 도움으로 짐과 그의 어머니는 가까스로 피신하고, 도플러 박사의 집에 몸을 숨긴다. 짐과 그 일행은 본즈가 맡긴 상자에서 금속으로 만들어진 둥근 공을 발견하는데, 짐이 그 공을 잡고 비틀자 무수한 행성들로 가득한 3차원 홀로그래프 입체 영상이 방안에 펼쳐진다. 어려서부터 해적 이야기를 탐독한 짐은 그 행성이 바로 '보물성'이라는 사실을 간파한다.

어머니를 도와 여인숙을 다시 일으키고 싶은 짐은 모험을 떠나기로 결심한다. 짐은 초승달 모양의 크레센티아 우주항에 도착한다. 그곳에서 짐 일행은 어마어마한 위용을 자랑하는 우주 범선 로버트 루이스 스티븐슨 Legacy를 처음 보게 된다.

이 배의 아멜리아 선장은 짐에게 시중꾼 일을 맡기는데, 주방에서 일하게 된 짐은 주방장 존 실버를 만나게 된다. 인조인간인 실버는 짐에게 조금씩 정을 느끼게 되지만 짐은 철석같이 믿었던 실버가 선원들과 비밀리에 선상반란과 보물 약탈을 모의하는 것을 듣고 배신감을 느낀다.

짐과 아멜리아 선장, 그리고 도플러 박사는 실버가 주도하는 반란을 피하여 탈출한다. 그들이 추락한 곳은 바로 보물성! 짐은 보물성 숲 속에서 벤을 만난다. 외딴 별에서 친구를 만난 벤은 너무나 기쁜 나머지 추격해온 실버 무리를 짐의 친구들인 줄 알고 날뛴다. 결국 짐을 붙잡은 실버는 목숨을 살려주는 조건으로 보물 지도를 요구한다.

벤과 짐은 어마어마한 기계장치가 매설되어있는 지하 세계를 발견하는데, 실버와 그의 해적 무리들은 플린트의 보물이 보물성의 중심에 있는 기계장치 속 어딘가에 숨겨져 있다는 것을 알아낸다. 그러나 보물을 손에 넣었다고 확신하는 순간, 행성 전체가 폭발음과 함께 서서히 파괴되고 있는 것을 발견하는데... 과연 실버는 평생 동안 찾아 헤맸던 보물을 모두 포기할 것인가!